水稻机插秧施用基肥，是确保水稻机插秧增产增收不可或缺的重要措施，也是水稻机插秧整个施肥过程中的关键一环。
施用基肥时，可结合旋耕作业，根据土壤地力、茬口等因素施用基肥，并坚持有机肥和无机速效化肥相结合施用的原则。一般移栽前5-10天每亩施粪肥1000-1500公斤或25%复合肥50-80公斤用以培肥地力；中等肥力大田，每亩施35%水稻专用肥30公斤或25%复合肥40公斤或BB肥20公斤作底肥；先施肥再耕翻，以达到全层施肥，土肥交融，上下肥力均匀。
另外，实施秸杆还田较多的田块，在插秧前一天，需亩增施碳酸氢铵10～15公斤作面肥，避免秸杆在腐烂过程中形成生物夺氮而造成土壤中速效氮肥暂时亏缺现象。
