二化螟有转株危害习性，初孵幼虫先集中于叶鞘，2龄开始分散转移危害。1头幼虫可造成数株枯心苗；二化螟幼虫蛀入水稻后有用药防治效果差，应在幼虫钻蛀危害前用药防治。对于具体的防治指标，可以掌握在孵化高峰后5-7天，枯鞘率籼稻达0.5％-O.8%、粳稻达1％时用药，田间虫口数量大时隔5-7天再用药。
目前登记用于防治二化螟的药剂有杀虫单、杀虫双、三唑磷、二嗪磷、乙酰甲胺磷、稻丰散、毒死蜱、杀螟丹、阿维菌素、丁烯氟虫腈、氯虫苯甲酰胺等及其复配剂。我省二化螟对杀虫双和杀虫单已产生了较高的抗药性，生产上不宜再使用这两种药剂防治二化螟。部分地区的二化螟对三唑磷也产生了较高的抗药性，在使用三唑磷防效不佳的地区宜换用其他药剂。阿维·毒死蜱和3％甲·克可以用于防治二化螟。
二化螟幼虫蛀入稻苗后，选用毒死蜱、阿维菌素等药防效差，宜选用有内吸性的药。氯虫苯甲酰胺为邻甲酰氨基苯甲酰胺类新型杀虫剂，主要通过激活兰尼碱受体，释放平滑肌和横纹肌细胞内储存的钙离子，引起害虫肌肉调节衰弱、麻痹，直至死亡。该药具有内吸性，施药后药物能通过木质部传导到新生组织，持效期长达20天左右，在二化螟蛀入茎秆危害，常用药难以防治的情况下，可以考虑选用该药防治。
水稻有很强的自我调节能力，受二化螟危害的水稻，到7月底8月初补偿生长出的分蘖仍能抽穗结实。当前对受害田块，除了用药治虫外，还应加强肥水管理，促进分蘖成穗，减少产量损失。
