甜椒、辣椒保护地栽培有四大难题：地温偏低、二氧化碳少、重茬死苗严重、土壤板结。秸秆生物反应堆和植物疫苗技术的应用，冬天20厘米地温增加4～6℃，二氧化碳浓度提高4~6倍，减少化肥用量60%，减少农药用量70%，连用3年可不施化肥、农药，成本降低60%以上，平均增产30%以上，成熟期提前15天，收获期延长30天。该技术应用方式分为：内置式、外置式和内外结合式三种，具体用法如下：
一、内置式秸秆生物反应堆和植物疫苗的使用方法
1.秸秆和其他物料用量：667平方米（1亩）使用秸秆4000～5000千克，饼肥100～150千克。严禁使用鸡、猪、人等非草食动物的粪便。
2.菌种、疫苗用量：667平方米使用菌种8～10千克，疫苗3～4千克。
3.处理菌种：使用当天，按1千克菌种掺20千克麦麸，掺和均匀，再加18千克水掺匀使用。如当天使用不完，摊放于阴暗处，厚度5～8厘米，第2天继续使用。疫苗处理方法同菌种。
4.处理疫苗：按1千克疫苗与20千克麦麸，混匀，再加水18千克搅拌均匀。为了能均匀接种疫苗，每667平方米将50千克饼肥、150千克草粉加水拌匀（以用手一攥，手指缝滴水为度），然后与拌好的疫苗拌匀成堆，温度达到50℃时翻堆2次。然后平摊于背阴处，高度8厘米，用纱网遮盖防苍蝇，处理5～7天待用。
5.操作时间：行下内置式，定植前7～10天进行；行间内置式，定植后开花前进行。
二、外置式秸秆生物反应堆操作、使用与管理
1．秸秆菌种用量：每次秸秆用量1000～1500千克，菌种用量2～3千克，全生育期加料3次。
2．操作时间：定植前建好反应堆，定植后及时开机抽气。
3.操作方法：在大棚进口的山墙内侧，距山墙60厘米，自北向南挖一个宽1米，深0.8米，长度略短于大棚宽度的沟（贮气池），从沟中间位置向棚内开挖一个低于沟底15厘米，向外延伸80厘米的通气道，通气道末端做一个下口直径为50厘米，上口内径为40厘米，高出地面20厘米的圆形交换机底座。整个沟体可用单砖砌垒，水泥抹面，打底，然后在贮气池上每隔50厘米横放一根小水泥杆，在杆上纵向每隔20厘米拉一道固定铁丝，就可进行铺放秸秆，每放50厘米厚，均匀撒接一层菌种，连续3～4层，最后淋水湿透秸秆，水量以下部贮气池中有积水20厘米为宜，盖膜保湿，靠交换机一侧要盖严，池两端各竖一根内经为10厘米，高1.5米的塑料管，以回氧气。
4.使用与管理：可以概括为“三补”和“三用”。
三补：（1）补气：储气池两端留气孔，反应堆上打孔，反应堆盖膜不可过严；反应堆上料加水当天就要开机抽气，即使阴雨天，也要开机2小时。（2）补水：建堆浇透水后，根据季节不同可10～20天补水1次，以保持秸秆湿润又不水分过多为宜。（3）补料：外置反应堆一般使用50～60天，秸秆消耗在60%，此时应及时补充秸秆和菌种，补秸秆1000千克，菌种2千克，浇水湿透后，用直径10厘米尖头木棍打孔通气，然后盖膜。
三用：（1）用气：要坚持开机抽气，苗期每天3～4小时，开花期5～6小时，结果期拉开草帘就开机，盖草帘前半小时关机。（2）用液：按1份浸出液对2份水，喷施叶片，每月进行2～3次，也可结合每次浇水进行冲施。（3）用渣：将外置反应堆的渣收集起来，作追肥或底肥使用。
