玉米黑粉病的病原菌为真菌（担孢子菌），病瘤内的黑粉是病菌的冬孢子。冬孢子可以在土壤中、茎叶上、土杂肥中越冬。越冬的冬孢子成为第二年发病的初浸染病源。冬孢子在适宜的条件下，萌发产生担孢子和次生担孢于，随风雨、气流传播到玉米的叶片、节、腋芽、雌穗、雄穗等幼嫩部分，侵入组织，病菌在组织内生长蔓延，形成病瘤。病瘤老熟破裂，又散出黑粉（冬孢子），进行再次侵染。低温、干旱、少雨的地方，土壤中的冬孢子存活率高，存活时间长，发病重；玉米生育期间都可以染病，尤以抽雄期前后，天气干旱，植株抗病力弱，易感黑粉病。前期干旱，后期多雨，或旱湿交替出现，延长了染病期，易发病。
