辣椒根腐病是一种土传病害，是辣椒的常见病害。各地均有分布。一般发病率较低，严重时发病率可达30%-50%，可导致绝产。
发病初期病株枝叶特别是顶部叶片稍见萎蔫，傍晚到次日早晨恢复，症状反复数日后叶片全部萎蔫，但叶片仍呈绿色；病株的根茎部及根部皮层呈淡褐色及深褐色腐烂，极易剥离，露出木质部；横切茎观察。可见维管束变褐色，后期潮湿时可见病部长出白色至粉红色霉层。
防治方法：
1.连续多年种植辣椒的菜田与大白菜、甘蓝、大蒜、大葱等蔬菜作物实行3-5年的轮作到茬，特别是辣茬，可减轻、减缓辣椒根腐病的为害程度。
2.一般情况辣椒苗要自育，绝对不要在发病区购买辣椒种苗，以有效杜绝因辣椒种子、苗期而引起辣椒根腐病的传播发生。
3.辣椒种植采用高垄栽培，做成90cm宽的高垄，一垄栽双行。既利于提早封垄，又利于通风采光和田间管理；使用充分腐熟的有机肥，中后期追肥，采用配制好的复合肥母液随浇水时浇施，或顺垄撒施后浇水，防止人为管理造成辣椒根部受伤。
4.如在田间发现中心病株，应立即拔除，带出田外烧掉，然后用生石灰拌土处理掩埋病穴以杀菌消毒。
5.同一地块高垄栽培比低垄栽培明显发病轻，用塑料薄膜覆盖发病轻，生产中应高垄栽培并用塑料薄膜覆盖。不要大水漫灌，有条件可进行滴灌。保持土壤半干半湿状态，及时增施磷钾肥，增强抗病力。
6.①定植时用抗枯灵可湿性粉剂900倍液，或恶霉灵可湿性粉剂300倍液浸根10-15分钟。②定植缓苗后，在发病前用向农4号可湿性粉剂800倍液加强力生根剂，隔7-10天对辣椒逐株灌根。连续3-4次。③定植后浇水时，随水加入硫酸铜冲入田中，每亩用量为1.5-2kg，可减轻发病。④药剂防治关键是早防早治。以防为主。田间出现中心病株时马上浇灌5%丙烯酸恶霉·甲霜水剂1000倍液，或2.5%咯曲腈悬浮剂1000倍液+68%精甲霜锰锌水分散粒剂600倍液，或40%多·硫悬浮剂500倍液，或35%福·甲可湿性粉剂800倍液，或50%氯溴异氰尿酸可溶性粉剂1000倍液，或50%福美双可湿性粉剂1000倍液。或20%二氯异氰尿酸可溶性粉剂300-400倍液或3%恶霉·甲霜水剂600倍液。
