1.选用抗病品种：如滑身苦瓜、英引苦瓜、江门大顶苦瓜、槟城苦瓜、穗新2号、夏丰2号、湛油苦瓜、永定大顶苦瓜、89-1苦瓜、玉溪苦瓜、成都大白苦瓜等对苦瓜蔓枯病抗性较强。
2.实行2～3年与非瓜类作物轮作，拉秧后应彻底消除瓜类作物的枯枝落叶及残体。
3.选用无病种子，或用温汤浸种5～10分钟。
4.施用充分腐熟的沤肥，适当增施磷、钾肥，生长期要加强管理，注意放风，浇水后避免闷棚，加大通风排湿。
5.药剂防治：发病初期选用70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液;或50%扑海因可湿性粉剂800倍液;或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液;或40%多硫胶悬浮剂400倍液;或40%咪鲜胺800倍液喷雾。亦可用5%百菌清粉尘剂，或5%加瑞农粉尘剂1千克/亩喷粉防治。
