1.选用抗病品种，培育壮苗。该病对番茄植株侵害越早，发病率越高，所以预防要从育苗期抓起。选用抗病品种，做到早防早控。苗床周围杂草要除干净，苗床土壤要进行消毒处理，减少病源。用806植物生长液或基因活化剂浸种。苗床用806植物生长液300倍液喷后整地，并覆盖40-60目防虫网隔离害虫迁飞入棚。
2.重防烟粉虱。一定要重视烟粉虱的防治。可用异丙威熏蒸，穿插喷雾；或者每隔7-10天选用阿维菌素、扑虱灵、烯啶虫胺、氟啶虫胺、螺虫乙酯、呋虫胺等全田喷施，注意轮换用药，避免产生抗药性。
3.农业措施。适当控制氮肥用量和保持田间湿润。施肥灌水要少量多次，适时放风，避免棚内高温，调节好温湿度。增施有机肥，促进植株生长健壮，提高植株的抗病能力，生长期可用806植物生长液冲施或灌根，结合喷施基因活化剂，提高植株的免疫力。及时清除田间杂草和残枝落叶，以减少虫源。在绑蔓、整枝、打杈、蘸花和摘果等操作时，应先处理健株，后处理病株，注意手和工具要用肥皂水或磷酸三钠溶液充分擦洗，减少人为的传播。
4.实行轮作换茬。发病严重的地块要与茄科以外的作物实行三年以上的轮作。如换茬种植黄瓜、豆角、葡萄等，避免间套作和连作，减少和避免番茄病毒病土壤和残留物的传毒；育苗地和栽植棚地应彻底清除带毒杂草，减少毒源；推广配方施肥技术，喷施爱多收或植宝素，增强寄主抗病力。
5.药剂防治。在番茄分苗、定植、绑蔓、打杈前先喷1%肥皂水加0.2%-0.4%磷酸二氢钾混合液或1∶20-40倍液的豆浆或豆奶粉，预防接触传染。在定植前后各喷1次NS-83增抗剂100倍液，能增强番茄耐病性。在发病初期(一般在5-6叶期)开始喷药保护，配方为一桶水(15公斤)+10克尿素+12克安泰生+宁南霉素500倍液+芸苔素或爱多收6000倍液，4天喷1次，下午3-4点喷药，连续喷3次。
