棉花适宜的土壤酸碱度为pH6.5-7.5。土壤酸碱度对根系吸收矿质养分有两种作用。一方面改变盐类的溶解度。当土壤溶液碱性增高时，铁、铜、锌、钙、磷的溶解度降低，从而吸收减少；当土壤溶液酸性高时，虽能增大各种金属离子的溶解度，有利于根系吸收，但易被雨水淋失，所以酸性土壤中往往缺乏钾、钙、镁、磷等元素。另一方面，溶液的酸碱度能影响细胞膜电荷性质，改变质膜对矿质元素的透性。组成细胞质的蛋白质是两性电解质，在弱酸性环境中，氨基酸带阳电荷，易吸附外部溶液中的阴离子；在弱碱性环境中氨基酸带阴电荷，易吸附外部溶液中的阳离子。
