常有菜农反映，随着保护地蔬菜种植年限的增加，施入的肥料增多，可是蔬菜不但没有长好，反而色淡叶小，长势越来越差，病害越来越多，导致经济效益下降。这是由于保护地种植蔬菜，土壤长期得不到雨水淋洗和阳光直射，加之蔬菜连作引起自身原因，出现了土壤障碍，成为生长发展的一大威胁。
一、连作障碍的主要表现
1、土壤盐渍化。施入的肥料不受雨水淋溶损失，除了部分被作物吸收外，未被吸收的养分全部留在土壤中，使土壤溶液浓度高。而且由于毛细管作用，土壤水分总是向上移动，这样导致了耕作层盐分增加，土壤盐渍化。
2、土壤酸化。大多数蔬菜适于生长在中性环境中，保护地土壤中残留的氮在微生物的作用下，以硝酸形态大量积聚，使土壤酸化严重。
3、土壤结构遭到破坏。生产中所施化肥仅30％左右被作物吸收利用，其余部分则沉积在土壤中，造成土壤板结，有益菌活性降低。
4、连作障碍及蔬菜自毒。由于保护地主要种植少数经济价值高的蔬菜，一般重茬较多，这样就造成了土传病害增多土壤中害虫增加，养分匮乏和比例失调，从而导致了蔬菜发生缺素症。同时只种一种蔬菜它本身排泄的一些有害物质在土壤中积累，影响其生长发育。
二、综合防治措施
1、高温晒垄。在夏季蔬菜收获完后，及时撤掉棚膜，深耕土地进行夏季晒垄。杀灭部分土壤中的有害菌
2、轮作。夏季保护地蔬菜生产空闲时间种植玉米或其他大田作物，可起到轮作换茬作用，对改良土壤结构，减少病害发生有明显的效果。
