辣椒疫病在整个生育期都可发生，且易造成毁灭性损失。苗期受害，茎基部呈水浸状软腐，其上部呈暗绿色而倒伏。成株期危害主茎、枝条、果实、叶片及花瓣。茎基部及枝条受害，初为水浸状斑点，后扩大且变黑褐色，并常易从病部处折断，受害株病情发展迅速，染病后20天左右便整株枯死。病果呈不规则暗绿色水浸状病斑，软腐，常见白色霉状物，略皱缩，后渐变为灰白色，最后成褐色或黑色僵果。根部受害变褐色、腐烂，植株萎焉，但维管束不变色。根腐、枝枯及烂果所造成的损失都很严重。该病在高温多湿条件下易发生、流行，特别是在夏秋季大雨或暴雨后病害蔓延快。
防治方法：(1)实行水旱轮作，避免与茄科、葫芦科作物连作。(2)用25％甲霜灵1000倍液浸种2小时后，用无病新土育苗，以防种子带菌。(3)采用高畦种植，避免积水，注意控制浇水量和次数。(4)定植后用氧氯化铜800～1000倍液淋根部和喷洒植株。(5)发病后用扑霉特、露克星、可杀得、瑞毒霉喷洒，防治效果较好。
