1、加强植物检疫，不从病区引种，必须引种时，用1%石灰水或80%402抗菌剂2000倍液浸种2天或50倍液的福尔马林浸种3小时闷种12小时，洗净后再催芽。也可选用浸种灵乳油2ml，对水10-12L，充分搅匀后浸稻种6-8kg，浸种36小时后催芽中。还可用中生菌素100倍液，升温至55℃，浸种36-48小时后催芽播种。
2、选用适合当地的2-3个主栽抗病品种。早稻抗病品种有：嘉育280，皖稻61号，赣早籼40号，中优早81号，湘早籼21号、22号，培两优288，桂引901。中稻抗病品种有：嘉45号，秀水1067，皖稻28，皖稻32、34、36、36、38、59、61号，汕优多系1号，湘粳2号，七袋占1号，八桂占2号，三培占1号，航育1号。晚稻抗病品种有：沈农514，滇籼13号、14号，滇粳糯39号，滇粳40号，宁粳15号、16号、17号，宁糯4号等。山东表现中抗的品种有H301。粳稻品种对我国7个白叶枯病菌株(致病型1-7)抗至中抗的品种有：DP5165，95鉴27，加45，95鉴25，96鉴35，宁93-38，宁波2号，台537，D602等。
3、农业防治，提倡施用酵素菌沤制的堆肥，加强水浆管理，浅水勤灌，雨后及时排水，分蘖期排水晒田，秧田严防水淹。妥善处理病稻草，不让病菌与种、芽、苗接触，清除田边再生稻株或杂草。
4、药剂防治。发现中心病株后，开始喷洒20%叶枯宁(叶青双)可湿性粉剂，每667m2用药100g，对水50L，用叶枯宁防效上不去时，可在施用叶枯宁同时混入硫酸链霉素或农用链霉素4000倍液或强氯精2500倍液，防效明显提高。此外，每667m2还可选用10%氯霉素100g或70%叶枯净(杀枯净)胶悬剂100-150g、25%叶枯灵(渝-7802)可湿性粉剂175-200g，对水50-60L喷洒。也可在5叶期和水稻移栽前5天，各喷中生菌素500倍液1次或用50%氯溴异氰尿酸水溶性粉剂(消菌灵)，每667m2用量为25-50g，对水50kg喷雾。