黄瓜主要病害有霜霉病、枯萎病、疫病、炭疽病、白粉病、细菌性角斑病和病毒病，设施栽培的还有根结线虫病。防治措施如下：
1.根结线虫病：关键在于预防。首先培育无病虫种苗，其次采取耕作栽培防治、土壤处理防治和化学防治相结合的综合防治措施。由于根结线虫常分布在地表25cm左右的土层中，收获作物后及时清除病残体，集中烧毁，深翻土地40～50cm，条件允许时用水浸泡，降低土壤通透性，能有效地抑制根结线虫的活动，使病原线虫大大减小；棚室栽培的利用夏季高温撒生石灰1000kg/hm2的，然后灌或淋一次透水，覆膜闷棚15d，使地表温度达60℃以上，能有效杀死根结线虫；定植前1～2d用0.1%啊维菌素可湿性粉剂90kg/hm2、或10%福气多颗粒剂30kg/hm2沟施或穴施，或定植时用1.8%啊维菌素乳油1000倍液作定根水。
2.枯萎病：选用抗病品种如园丰园6号；选用无病虫的基质育苗或采用营养杯、穴盘育苗，避免定植时伤根；与其它非葫芦科作物轮作；嫁接防病，这是目前生产上预防瓜类枯萎病最有效的方法，黄瓜用黑籽南瓜作砧木；加强田间管理，施用充分腐熟的肥料，避免干湿不均；药剂防治：目前尚未有很好的药剂能防治该病。分别在瓜类作物定植时、伸蔓期及开花结果期用10%双效灵水剂250倍液或20%好靓可湿性粉剂2500～3000倍液、绿亨一号3000～4000倍液等灌根，每株灌药液0.5kg，预防效果较好。
3.霜霉病：选择抗病品种，选择地势较高排水良好的田块种植，合理密植，及时清除田间病残体，注意发现中心病株及时用药，发病初期交替使用72.2%普力克水剂500～700倍液或72%克露可湿性粉剂500～700倍液、58%雷多米尔锰锌可湿性粉剂500～800倍液，喷药要及时、到位(叶片正反两面)、持续，每5-7d1.次，连续2-3次。
4.疫病：水旱轮作，增施p、k肥，排水降湿;发病初期及时喷药，可选用甲霜灵锰锌、杀毒矾、克露、甲霜铜、普立克和科佳等杀菌剂等交替使用
5.炭疽病:控制肥水，增施p、k肥;排水降湿;用施保克1000倍，爱苗4000-6000倍，百菌清800倍70%托布津1000倍，
6.白粉病:选择抗病品种，选择地势较高利于排水的田块种植，忌偏施氮肥，及时清除田间病残体，注意发现中心病株并及时施药，发病初期，可用45%超微粒硫磺胶悬液150～300倍液、15%粉锈宁可湿性粉剂1500倍液、25%百里通可湿性粉剂2000～2500倍液等交替喷洒。喷药时叶面叶背一起喷，每隔4～5d喷一次，连喷2～3次。
7.细菌性角斑病:轮作;避开夏季高温多雨季节种植;施石灰或施用碱性肥料，调节土壤PH值;实行高畦深沟栽培;避免中耕伤根;淋药预防：用农用链霉素3000倍DT400倍或可杀得600倍.
8.病毒病:种植时用银黑双色地膜覆盖(银色朝上)避蚜；及时防治蚜虫，用高效低毒药剂如2.5%功夫或40%菊马乳油及新型抗蚜灵、避蚜雾等进行防治；发现病株及时拔除，发病前或初期，用好普水剂500倍、病毒K500～1000倍、沃施克可湿性粉剂1500倍等抗病毒药剂交替使用，预防的10～15d喷一次，防治的7d喷一次，连喷洒2～3次。
