设施蔬菜栽培与露地栽培的环境条件区别大，室温变幅大，空气湿度高，光照强度低，二氧化碳浓度不足，为病虫害的发生与流行提供了条件，常因防治不及时导致毁灭性灾害。
设施蔬菜病虫害主要特点为：
①土传病害重。土壤是蔬菜根系活动场所，也是病原菌越冬、越夏的场所，设施一旦建成，移动和轮作换茬困难，连作现象严重。因此，土传病害随栽培年限增加而不断加重。且多种病原菌随病株残体存留土壤中越冬，成为翌年的侵染源，是蔬菜病害发生、流行的重要原因。
②气传病害易流行。温室夜晚密闭保温，空气相对湿度达90％～100％；棚面气化水散落在植株上，使植株叶面形成水膜，造成高湿的环境，对蔬菜生长不利，有利于多种病菌的萌发、侵染和繁殖。特别是霜霉病等气流传播的病害，在叶面结成水膜3小时左右便能萌发，侵入寄主。防治不及时则传播相当迅速，引起流行。轻者造成减产，重者甚至绝收。
③害虫世代期短。温度对害虫分布、生育历期及为害特点影响较大。如侧多食跗线螨、白粉虱、美洲斑潜蝇等在北方寒冷地区不能露地越冬，但可在温室中越冬繁殖为害蔬菜，并形成虫源基地。蚜虫、红蜘蛛虽可露地越冬，但在温室越冬繁殖世代完成期短，繁殖代数多，为害加重。
④生理障碍加重。温室栽培易发生生理病害。如磷元素的不足，使植株茎、叶变细，叶深绿，小而无光，根系发育不良，生长缓慢，植株矮小；缺钾的叶缘变黄绿，叶脉失绿，并出现斑驳，叶片坏死；缺镁的叶脉间多肉部分发黄，严重时发生坏死；缺硼的根系不发达；生长点坏死，花器发育不全，果实畸形；土壤盐渍化会伤根，影响根系对养分的吸收等。同时室内长期密闭或半密闭状态，施肥不当，会造成氨气中毒，影响生长发育。上述障碍均由非病理性因素造成，露地发生较少。
