1.根据当地病虫害发生情况，确定用药种类。如果当地小麦苗期虫害发生很轻，病害发生较重，只用杀菌剂拌种即可，不必使用杀虫剂；如果病虫害混合发生，既要用杀虫剂拌种、还要用杀菌剂拌种。
2.准确掌握农药用量。用药量大小直接关系到防治效果和小麦种子出苗，要严格按照说明书要求进行拌种，无论用塑料袋还是拌种器均按比例配兑且须充分拨匀。
3.注意拌种方法。小麦用辛硫磷等拌种，应先将农药兑水稀释，再与麦种拌匀，覆盖堆闷后播种。小麦用三唑酮或立克秀拌种，应先将种子用清水喷至湿润，然后将药剂均匀地混拌在种子上，随后立即播种或阴干后播种。在病害和虫害混发区，可选用杀菌剂和杀虫剂同时拌种，要注意先拌杀虫剂，闷种晾干再拌杀菌剂；先拌乳剂，待吸收晾干再拌粉剂。粉剂拌种只能干拌,不能湿拌，以免引起药害。
4.随拌随播，不可久置。杀虫剂拌种后，一般堆闷2～3小时，最多5～6小时，待药剂被麦种吸收后随即播种。用杀菌剂拌种后，应随即播种或阴干后立即播种。有的农户在小麦药剂拌种后堆闷时间过长，或拌种后久置不播，也会对小麦造成药害。如果小麦用杀菌剂拌种后在日光下摊晒，则会显着降低防病效果。
5.严格按照规程操作。要严格按照拌种技术规程进行拌种，防止人畜中毒。拌药麦种应存放在阴凉干燥和小孩不能接触的地方，不可暴晒和受潮，不能用作人畜食用，拌种结束后必须洗手洗脸，确保安全。
