温室番茄在栽培过程中极易出现畸形果，如尖顶果、桃形果和指形果等，使番茄商品价值降低。
畸形果形成原因：
①花芽分化和发育时遇到连续5～6℃或3～4℃的低夜温，易产生畸形果，冬春茬西红柿1～2穗果易畸形多是此原因造成；
②苗龄拉长，低温或干旱持续时间长，幼苗处在抑制生长条件下，花器易木栓化，后转入适宜条件下，木栓化组织不能适应组织的迅速生长，则形成裂果，籽外露果或疤果；
③偏施氮肥，氮肥过多致使花芽过度分化，心室数目增多，形成多心室畸形果；
④使用激素不当造成，为防止番茄落花落果，番茄生产管理中经常使用2，4-D、番茄灵、防落素等蘸花激素，但浓度掌握高，重复蘸花。蘸花时温度高，土壤干旱等均产生畸形果，花未开展时蘸花易产生空洞果。另外，秧苗发生徒长时，使用植物生长调节剂浓度大或次数多，使秧苗控住，再蘸花时也易产生畸形果。
防治方法：
①加强苗期管理。培育适龄壮苗，幼苗破土后宜控制日温20～25℃，夜温13～17℃，保持土壤潮湿，育出节间短，60天左右的适龄壮苗；
②1～3穗果的第一果易形成畸形果，应在蘸花前疏掉；
③加强肥水管理。施肥时应氮、磷、钾配合，采用配方施肥，切忌偏施氮肥。同时根据植株长势、长相、天气和需水规律进行浇水，切忌忽干忽湿；
④严格执行蘸花技术：在同一花序中有3-4朵花蕾露出花萼和黄色花冠时开始喷花，同时做好标记。不可重复用药(最好加上红色或其他颜料以利区分)。蘸花以当天完全开放的花为最佳时机，即开即蘸。掌握好喷花时机：对花期不一致的花蕾采取分开处理，遮住未开放的花蕾，只喷施开放花序，不可涂柄处理。可选用保花保果可选用果霉宁(保果宁2号)，或番茄灵加适乐时均可。
