1、疣孢霉病又名湿泡病、自腐病、褐腐病、水疱病，是食用菌生产中危害严重且普遍发生的病害。适宜生长的温度为20℃，在通风不良，温度偏高，湿度大时易发生。菇体感病后，变为不规则的团体组织，菇体上覆盖一层白色絮状菌丝，似花菜菇或馒头菇，最后变成褐色软腐状，并有褐色液体溢出，散发出恶臭气味，继而腐烂。防治方法：出现病害后，及时拔除病菇和菌体，停止喷水，交替喷施50%多菌灵500倍液、50%施保功800倍液、70%甲基托布津1000倍液等。
2、细菌性斑点病病原菌广泛存在于自然界，通过空气、土壤、喷水、堆肥等途径传播。特别是使用不清洁的水喷雾，不通风或者通风过少，都容易发病。发病时菇体上出现针眼状病斑，后迅速扩大，变成褐色块状并腐烂。防治方法：喷水时使用清洁水，平时加大通风量，避免棚内湿度超过90%。
3、褐斑病又叫干泡病、轮枝霉病等。双孢菇从感病到出现褐色病斑，约需2周的时间。开始先在菇盖上产生许多不规则的针头大小的褐色斑点，以后斑点逐渐扩大，并产生凹陷，凹陷部分呈现灰色。防治方法：喷洒50%多菌灵可湿性粉剂500倍液。
4、软腐病子实体受到感染后，逐渐变为褐色，直至腐烂。防治方法：减少床面喷水，加强通风，降低空气湿度；向患病部位撒石灰粉；喷50%多菌灵可湿性粉剂800倍液。
