一、农业防治
在潜叶蝇为害重的地区，把潜叶蝇嗜好的瓜类、茄果类、豆类与其不为害的作物进行套种或轮作；适当疏植，增加田间通透性；蔬菜收获后，及时清除田间残株落叶、杂草，烧毁或沤肥，以减少田间虫口基数。
二、物理防治
利用潜叶蝇成虫对黄色的趋向特性，在田间悬挂黄板进行诱杀，每亩悬挂黄板20-30块，悬挂高于作物冠层10厘米，20-30天更换1次。或者覆盖20-25目防虫网，阻止成虫迁入蔬菜上产卵为害。
三、化学防治
可选用75%灭蝇胺可湿性粉剂3000倍液，或3.2%阿维菌素乳油1500倍液，或4.5%高效氯氟氰菊酯乳油1000倍液，或30%辛硫•氟氯氰乳油1000倍液，或20%氰戊菊酯乳油2000倍，叶面喷雾，并注意叶片正反两面喷透。由于潜叶蝇发生期长、世代重叠明显，须每隔7天用药一次，连续防治2-3次，注意轮换用药，延缓害虫产生抗药性。
