为了防止玉米纹枯病从次要病害上升为主要病害，降低防治成本和防治难度，减轻危害。治理策略上树立选育和推广抗病品种，以农业防治为主，化学防治为辅的指导思想。在玉米纹枯病零星或轻发生区采取应用抗病品种和农业治理措施，即可控制其危害，并压低田间菌源基数；在玉米纹枯病中度或重发生区，要采取综合治理的方法从根本上控制该病的发生，切忌单一采用化学防治来控制。
玉米纹枯病的综合治理措施：
1、选育和种植抗病品种。建议玉米育种家在选育玉米品种时要充分考虑选择抗玉米纹枯病的材料，选育出中抗或高抗玉米纹枯病的品种。推广部门应选择叶片大小适中并向上倾斜生长的品种，如豫玉26号、浚单18号、济单7号等品种。叶片过于宽大，生育期长的杂交品种不利于通风透光，发病重。
2、农业措施。
（1）科学运筹肥料。施足基肥，适施氮肥，增施有机肥，补施钾肥，配施磷锌肥。
（2）合理密植。提倡宽窄行种植或扩行缩株种植，改善田间通风透光条件。
（3）加强田间管理。配套田间沟系，降低田间湿度，控制发病条件。培土壅根防倒伏，抑制菌丝生长
（4）化学除草或人工除草。使用土壤封闭除草技术或人工锄地，除去杂草，可通风透光，降低田间湿度，减轻发病。
（5）摘除基部老叶病叶，带出田外销毁。在改善田间小环境的同时，也不影响产量。
（6）玉米收获后及时清除田间病残体，并进行深耕翻土，以消灭越冬菌源。
（7）病害严重地块，实行与非禾本科作物轮作，如种植大豆、花生等。
3、药剂拌种或包衣。
（1）尽可能使用包衣种子，没有包衣的种子亩用10毫升适乐时加水200克拌种或用12.5%禾果利或志信星可湿性粉剂10克加水200克拌种2~3公斤，凉后点种。
（2）适时施药防治。田间病株率达到3-5％时，每亩用5%井岗霉素100-150毫升，或12.5%禾果利或志信星可湿性粉剂30克，或25%粉锈宁可湿性粉剂50克，或20%纹枯净可湿性粉剂25克，加水50-60千克，对准发病部位均匀喷雾。一般间隔7-10天再用药防治1次，连喷2次，提高药剂的防治效果。
