由于大棚蔬菜具有高温、高湿、封闭和连茬种植的特点，为蔬菜病虫的周年危害和繁殖提供了适宜的气候条件及越冬场所，有利于蔬菜病虫害的发生流行，从而使蔬菜病虫害种类增多，危害程度显著加重，不少病虫危害日趋猖獗。防止好蔬菜病虫害已是发展蔬菜生产的必须，也是菜农的迫切要求
(一)大棚蔬菜处于高温、高湿的条件下，有利于某些病虫害的发生蔓延。例如黄瓜霜霉病、灰霉病、菌核病、番茄早疫病、晚疫病、叶霉病、茄子黑枯病、黄瓜细菌性角斑病、缘枯病、叶枯病、圆斑病、番茄青枯病、竦椒叶斑病、溃疡病、菜豆细菌性疫病等，这些病害过去在露地蔬菜上很少发生或发生很轻，但随着大棚蔬菜的发展而逐年加重，成为大棚蔬菜的主要病害。再是某些虫害随着大棚蔬菜的发展也日趋猖獗。例如蚜虫、白粉虱、潜叶蝇、蓟马、茶黄螨、红蜘蛛等，这些虫害在北方一般不能露地越冬，但在大棚高温条件下，继续繁殖为害并形成虫源基地，已发展成为大棚蔬菜的主要害虫。此外，由于大棚蔬菜越冬期间处于封闭状态，温度、水分、光照、空气变化较大，以及喷施农药、大量追肥、应用激素过量等，致使大棚蔬菜发生生理障害，影响蔬菜的正常生长。
(二)大棚蔬菜多是连年重茬种植，某些病害大量菌源积累增多，尤其是一些土传病害日趋严重。例如黄瓜枯萎病、茄子黄萎病，多种蔬菜的根结线虫病，黄瓜、竦椒的疫病，黄瓜、西葫芦的蔓枯病，番茄、辣椒的青枯病，菜豆炭疽病、多种蔬菜的菌核病、根腐病等发生危害逐年加重，这些都与大棚蔬菜不易轮作、连年重茬有关。
(三)防治不得当。目前，广大菜农普遍缺乏病虫害防治技术，由于病虫种类繁多，一般对病虫害不会识别，农药品种多，对某些药剂不会使用。因此，普遍存在着重治轻防，重药轻养，不重不治，重了乱治的现象。有些人认为所谓防治就是打药，以农药为主，多药混用，随意加大药量，结果造成药害。也有的使用生长激素过量，或乱用除草剂，造成激素中毒或药害，使植株或果实畸形，影响生长发育，甚至绝产。由于防治不当，费工、费药，加重了危害，并使某些病虫害产生了抗药性，结果防治次数越来越多，用药量越来越大，病虫害越来越重，这是目前病虫防治上的一大难题。
