芹菜的病害主要有斑枯病、软腐病、菌核病等。防治斑枯病的药剂有75%百菌清可湿性粉剂800倍液，百菌清和多菌灵的安全间隔期发别为7天和15天；防治软腐病的药剂有农用链霉素200毫克/千克喷在叶柄和茎基部或用新植霉素3000-4000倍液，农用链霉素和新植霉素的安全间隔为5-7天；防治菌核病的药剂有25%多菌灵可湿性粉剂400-500倍液。虫害主要是蚜虫，防治方法为喷施0.3%苦参碱水剂800-1000倍液，安全间隔期为7-10天；或用50%抗蚜威可湿性粉剂，每667平方米每次用量为12-20毫升。
