牡丹品种较多，由于品种和栽培目的不同，采用的繁殖方法也不同。花单瓣，结籽多，根部发达，根皮厚，产量高，质量好，多用种子繁殖。山东荷泽等地的牡丹以观赏为目的，花重瓣大而美丽，多不结籽，多用无性繁殖。
1、种子繁殖
选无病害健壮植株，7、8月份，当果实呈现蟹黄色时分批摘下，摊放室内阴凉潮湿地上，经常翻动，待大部分果壳开裂，筛出种子，选粒大饱满的作种立即播种。若不能及时播种，要用湿沙土分层堆积在阴凉处。山东地区在播种前将新鲜种子用50℃温水浸种24-30小时，使种皮变软脱胶，吸水膨胀，易于萌发。亦有些地区播前用赤霉素（25PPm）浸种2-4小时，可提高出芽率并利于培育壮苗。8月中旬至9月上旬播种育苗，条播或点播。条播，按行距25厘米横向开沟，沟深5厘米，播幅约10厘米，每沟播拌有湿草木灰的种子100-150粒，然后覆细土3厘米，最后盖草。每亩用种30-50公斤。点播，行株距30厘米，株距20厘米，挖圆穴，穴深4-6厘米，穴底要平，穴内施入腐熟的人畜粪，然后每穴均匀播下4-5粒种子，覆细土约4厘米，再盖草厚4厘米左右，以防寒保湿。每亩播种量约50公斤。如遇干旱应注意浇水。
如管理得当，幼苗于第2年即可出圃。苗小的要到第3年才能移栽。
幼苗于第2年9-10月移栽，大小苗要分别栽种便于管理。在整好的地上按株行距40×50厘米打穴，穴深20厘米左右，穴长20-25厘米，穴打成上高、下低的斜坡，由高渐低。穴底掏平后，每穴栽大苗1株或小苗2株，壅土，轻轻将苗稍向上提，使根与土密接，然后添土略高于畦面，轻轻压实。安徽铜陵再放饼肥或人粪尿，然后盖土。移栽时要注意根要舒展，不能卷曲。每亩可栽苗3000-5000穴。
2、分株繁殖无性繁殖多采用分株方法，种株以3年生的为好。在采收时将牡丹全株挖起，抖落泥土，顺着自然生长的形状，用刀从根茎处分开。分株数目视全株分蘖多少而定，每株留芽2-3个。栽植时宜选小雨后进行，按行株距各66厘米打穴，栽法同育苗移栽。
此外，尚可用嫁接，扦插繁殖，多用于观赏牡丹皮品种。
病虫害防治
1、病害
叶斑病：带病的茎、叶是本病的传染源。常发生在春、夏季，主要危害叶片、茎部，叶柄也会受害。防治方法：发现带病的茎、叶，及时剪除、并清扫落叶集中烧毁；发病前后喷1∶1∶100波尔多液，每10天1次，连续数次。
牡丹锈病：病株残叶是本病的传染源。多在4-5月时晴时雨、温暖潮湿或地势低洼的情况下发生，主要危害叶片，6-8月发病严重。防治方法：收获后将病株残叶集中烧毁；选择地势高燥、排水良好的土地，作高畦种植；发病初期，喷波美0.3-0.4度石硫合剂或97%敌锈钠400倍，7-10天1次，连续多次。
菌核病：带菌核的土壤是本病的传染源。多在春季造成茎、叶部发病。从幼苗期到成株期都能发生。防治方法：与禾谷类作物轮作；在春季雨水多时，做好清沟排水，降低湿度，减轻发病；早期发现病株，带土挖出，病穴用石灰消毒，必要时周围喷50%托布津1000倍液。
牡丹白绢病：带病菌的土壤、肥料是本病的传染源，尤其以红薯、黄豆为前作时，发病严重。多在开花前后，高温多雨季节根和根茎部发病。防治方法：与禾本科植物轮作，不宜与根类药用植物以及红薯、花生、蚕豆等作物轮作；栽种时用50%托布津1000倍液浸泡种芽；发现病株带土挖出烧毁，病穴用石灰消毒。
根腐病：土壤中的病残体或种苗是本病的传染源。主要危害根部。在多雨季节发病重，随着病情加重，全株枯死。防治方法：同菌核病防治。
2、虫害
蛴螬：为铜绿金龟子的幼虫。全年均有危害，以5-9月严重。危害根部，咬成凹凸不平的空洞或残缺破碎，造成地上部分长势衰弱或枯死，严重影响产量和质量。防治方法：早晨将被害苗、株，扒开捕杀；灯光诱杀成虫；用50%辛硫磷乳油或90%敌百虫1000-1500倍液浇注根部；3%呋喃丹颗粒剂每亩2公斤，拌湿润的细土20-50公斤；结合中耕除草沿垄撒施。
小地老虎：又名"地蚕"，是一种多食性的地下害虫。一般在春、秋两季危害最重，常从地面咬断幼苗或咬食未出土的幼芽造成缺苗断株。防治方法：清晨日出之前，在被害苗附近人工捕杀；低龄幼虫期，用98%的敌百虫晶体1000倍液或50%辛硫磷乳油1000倍液喷雾；幼虫高龄阶段可采用毒饵诱杀，每亩用98%的敌百虫晶体或50%辛硫磷乳油100-150克溶解在3-5公斤水中，喷洒在15-20公斤切碎的鲜草或其它绿肥上，边喷边拌均匀，傍晚顺行散在幼苗周围，能收到很好的防治效果。
钻心虫：多在春季发生，成虫在根茎处产卵，孵化后，幼虫钻入根部，逐渐向上蛀食，轻者茎叶枯黄，重者全株死亡。防治方法：发现被害植株，折断根茎，捕杀害虫；用80%以上敌百虫800-1000倍液喷雾，或每亩用2.5%敌百虫粉剂喷洒。
白蚁：因施用饼肥常易诱来白蚁，蛀食根皮，伤害嫩芽，受害后叶卷黄。防治方法：在白蚁未出洞前施用饼肥，勿接触根部；用新茶子饼水或50%辛硫磷200-500倍液淋灌根部。
