水稻是吸硅量最多的作物之一，茎叶中的含硅量可达10％~20％。每生产100千克稻谷稻株要吸收硅酸17~18千克。根部所吸收的硅随蒸腾上移，水分从叶面蒸发，大部分硅酸积累于表皮细胞的角质内，形成角质硅酸层。因硅酸不易透水，所以有降低蒸腾强度的作用。充分吸收硅的水稻叶片伸出角度小，叶成直立，受光姿态好，可增强光合作用的能力。硅酸的存在还能增强根部的氧化力，能使可溶性的二价铁或锰在根表面氧化沉积，不至于因过量吸收而中毒。同时，促进根系生长，改善根的呼吸作用，促进对其他养分的吸收。施用硅肥，水稻同化作用旺盛，干物质积累量大，从而稀释植物体内氮的浓度，表现为增强耐氮性。施硅酸肥料还可促使磷向穗部转移。
缺硅的水稻体内可溶性氮和糖类增加，容易诱致菌类寄生而减弱抗病能力。已有研究认为，茎叶中的硅酸化合物能对病原菌呈现某种毒性而减少危害。水稻生殖生长长期如不能满足硅酸的的供应，则易降低每穗粒数和结实率，严重时变成白穗。
