水稻进入孕穗末期，即将抽穗。孕穗末抽穗初，最易受稻瘟病菌、稻曲病菌、螟虫的侵染，而发生穗颈瘟、稻曲病和螟虫白穗。水稻孕穗末抽穗初期，是防治病虫害非常关键的时期。
一、稻瘟病
水稻上的稻瘟病，前期是叶瘟的危害，后期是穗瘟的危害。抽穗始期，是稻瘟病菌侵染稻穗而发生穗颈瘟的主要时期。前期叶瘟轻，抽穗期天气好，穗颈瘟或多或少也有发生；前期叶瘟重，或抽穗期低温阴雨，穗颈瘟流行。目前，我县二半山常年稻瘟重发区水稻正处孕穗末期。把好稻瘟防治最后一道关，需抓住水稻孕穗末抽穗初这个关键时期，抢晴天喷施药剂预防稻穗瘟。大部分田块，施好这次保险药，就能控制穗瘟的危害；前期叶瘟重发田或伤肥田，需在齐穗期再施一次，才能完全控制穗瘟的危害。
二、螟虫
水稻螟虫，分蘖期危害形成枯心苗，孕穗期危害形成白穗。抽穗孕期，是稻螟虫侵染稻穗而发生螟害白穗的主要时期。防治螟虫危害水稻造成白穗，关键措施是大鱼鳅肚期喷施杀虫单等药剂。
三、稻曲病
稻曲病俗称"丰收果"，是谷粒上形成墨绿色1厘米左右圆球的"稻曲"代替谷粒，一穗有一至数粒，多到几十粒。该病主要发生在二半山迟晚熟稻田，始于抽穗期，盛于扬花灌浆期，终于乳熟期。水稻长势茂盛，迟栽晚熟田抽穗扬花期多雨高湿、气候回暖，有利病菌侵染。我县近年二半山杂交稻中晚熟品种逐年增加，抽穗扬花期正逢8月低温阴雨，加重该病的发生。稻曲病的综合防治，在落实不偏施氮肥等保健栽培的基础上，喷井冈霉素、咪鲜胺、戊唑醇、己唑醇等来防治。
水稻穗期病虫害的综合防治，重点针对稻穗瘟、稻曲病和稻螟虫，抓住孕穗末抽穗初这一关键时期，混合喷施三环唑、三唑酮或井冈霉素、杀虫单等药剂，主治纹枯病和螟虫，兼治云形病、鞘腐病、稻曲病、飞虱、蓟马、蝽象。稻瘟病区加喷三环唑或稻瘟酰胺防治稻瘟病。
