小麦纹枯病在小麦不同生育时期，均可受感染，小麦出苗后，在土壤中越夏的病菌侵染麦苗的地下茎和茎基部叶鞘。到小麦返青后，受害麦苗基部叶鞘上出现浅褐色椭圆形或菱形病斑，中部灰色，边缘褐色，有的病斑轻度纵裂。
小麦进入拔节期以后，正是纹枯病侵略茎秆的时候，但在这一时期，由于小麦纹枯病主要发生在植株的茎基部，症状隐蔽，容易被人忽视而错过最佳防治时机。当病菌由叶鞘侵入茎秆后，常引起茎壁坏死变软，病部纵裂，植株失水枯死，遇到风雨天气，发生倒伏而造成严重减产。一般病田减产10％左右，重者可减产30％～40％。
一、选用中抗和耐病品种：目前生产上缺乏高抗纹枯病的小麦品种，秋种时尽量选用中抗、耐病或感病轻、丰产性好的品种。
二、合理轮作，加强田间管理：实行小麦与油菜、大豆、花生等轮作，减少田间菌源积累。适当降低播量，控制植株密度，增强麦田通透性。适当增施有机肥，平衡施用氮、磷、钾化肥，合理密植，及时除草和排水，改善麦田生态环境，培育壮苗，提高抗病性和补偿能力。
三、化学防治：以种子处理为重点，春季重病田喷药剂防治。
1、药剂拌种。当前施用效果较好的是用20%三唑酮乳油、25%三唑酮可湿性粉剂、15%羟锈宁可湿性粉剂、12.5%烯唑醇悬浮剂、3%戊唑醇湿拌剂等拌种，药剂用量为干种子量的0.02-0.03%。5.5%浸种灵2号乳油，每100公斤种子用药1克湿拌；或23%宝穗水乳剂，每100公斤种子用药20克湿拌。
2、喷雾。春季小麦病株率达20%的地块，应及时喷药，施药时间在小麦拔节初期，以阻止病害侵入茎秆。喷雾所用药剂可采用下列的一种：20%三唑酮乳油50毫升、15%或25%三唑酮可湿性粉剂分别为75克或100克，15%三唑酮可湿性粉剂75-100克、25%烯唑醇可湿性粉剂50-60克或12.5%烯唑醇悬浮剂100毫升等。
