西红柿茎部机械组织不太发达，茎多为半直立或半蔓性，少数品种为直立性。幼苗期组织柔嫩多汁，随着生长，茎逐渐强壮而木质化，栽培上要搭架。番茄植株初期直立生长，随植株长高、叶片增多、果实膨大，植株易倒伏。所以，需立支架或吊蔓。番茄茎的分枝能力强，每个叶腋都可长出侧枝，花序下第1侧枝生长最快。生产中进行多干整枝或换头生长时应留花序下的第1侧枝。番茄不整枝时，能够形成枝叶繁茂的株丛，大量侧枝会消耗养分，影响果实形成和膨大，生产中必须适时摘除侧枝。
西红柿顶端优势较强，主干出现花序后，顶端优势逐渐减弱，其花序下的侧芽能很快地生长成为侧芽枝，每个叶腋都能发生侧枝，侧枝上的侧芽也能形成新的侧枝，若任其生长，整个植株便会形成繁茂的株丛，造成营养生长与生殖生长的失调，影响开花坐果能力。所以要进行整枝打杈，使植株有一定的株型，以利通风透光，协调营养生长与生殖生长的关系。
番茄茎的丰产形态：节间较短，茎上下部粗度相似。徒长株（营养生长过旺）节间过长，茎由下至上逐渐变粗；老化株相反，节间过短，由下至上逐渐变细。
