小麦赤霉病的发生和流行受菌量、气候、品种抗性和栽培管理等各种因素影响，具有暴发性和间歇性的特点。在防治方法上应采取以农业防治为基础，结合选用抗病品种，关键时期进行药剂保护的综合防治措施。
1、选用抗性强品种。选择对赤霉病及其它病害有较好抗、耐性的品种，如皖麦27(91808)、皖麦32(2219)、扬麦158等。
2、进行种子处理。推广种子包衣技术，选择质量高、效果好的专用剂型进行包衣。药剂处理用40％拌种灵100克拌种50千克，可预防小麦的各种病害。
3、翻耕灭茬，消灭菌源。前作收获后，清除田间杂草，及时深耕，将桩、茬等残体翻埋土下，以加速分解，减少初侵染菌量。
4、加强栽培管理。适当早播，多施磷、钾肥。麦田要求深沟高畦，雨过田干，沟内无积水，田间湿度低。
5、药剂防治。药剂防治的关键时期是小麦始花期到灌浆阶段。第1次喷药应略早于病害盛发期，对轻病区可防治1次，重病区要防治2次。通常每亩用40％多菌灵150克，对水60千克喷洒，也可用50％托布津可湿性粉剂加水500-800倍稀释液喷洒，均能起到很好的防治效果。
