1、操作不规范，没有专用浸种的池子，浸种浓度随意，甚至有的农户在流动的溪流中浸种，或者连包装袋一起浸泡，导致种子与药液没有充分接触。效果自然很差。
2、浸种时间不足，一般需要浸种至少4个小时以上，最好12个小时至24个小时。部分农户只浸种两三个小时以内甚至仅半个小时不到。
3、可能用了不合格的农药，比如药剂质量不达标，甚至是假药，或者把拌种剂误认为是浸种剂。
4、催芽环节发病较多。部分农户催芽时温度过高，特别是育机插秧时秧盘集中堆放，导致催芽阶段温度偏高，病菌易侵染；部分旱育秧田覆盖薄膜导致苗床温度较高，也利于病菌侵染和病情发展。
5、可能长期使用同一种浸种剂，导致抗性，比如长期使用咪鲜胺，可以轮换使用25%氰烯菌酯悬浮剂2000～4000倍液、16%恶线
