根据水稻发“两迁”害虫、稻瘟病、纹枯病和南方黑条矮缩病的发生特点，水稻病虫防治可采取以下关键措施。
选用抗病品种防病技术因地制宜选用抗（耐）稻瘟病的水稻品种，淘汰抗性差、易感病品种，及时更换种植年限长的品种，是预防水稻病害最有效、最经济、最简便的措施。
种子处理和秧田阻断预防病虫技术咪鲜胺浸种，预防恶苗病和稻瘟病。单季稻和晚稻用吡虫啉、噻虫嗪或吡蚜酮拌种或浸种，或用20目防虫网或无纺布防护育秧，预防秧苗期稻飞虱及南方水稻黑条矮缩病、锯齿叶矮缩病、条纹叶枯病等病毒病和稻蓟马。秧苗移栽前3～5天施一次药，带药移栽，单季稻和晚稻预防稻蓟马、螟虫、稻飞虱及其传播的病毒病。
生物农药防治病虫技术苏云金杆菌（Bt）防治稻纵卷叶螟技术——在稻纵卷叶螟卵孵化盛期施用Bt，有良好的防治效果，尤其是在水稻生长前期使用Bt，可有效保护稻田天敌，维持稻田生态平衡。Bt对家蚕高毒，临近桑园的稻田慎用。井·蜡质芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、嘧肽霉素、春雷霉素等防治稻瘟病技术——在叶（苗）瘟出现急性病斑或发病中心和破口抽穗初期，均匀喷施井·蜡质芽孢杆菌或枯草芽孢杆菌或嘧肽霉素或春雷霉素，齐穗时再喷1次，对稻瘟病有良好的预防效果。井·蜡质芽孢杆菌防治稻曲病技术——在水稻孕穗末期或破口前7～10天，施用井·蜡质芽孢杆菌，可有效预防纹枯病。
生态工程保护天敌治虫技术释放稻螟赤眼蜂防治稻纵卷叶螟。田埂种植芝麻、大豆等显花植物，保护利用蜘蛛、寄生蜂、黑肩绿盲蝽、青蛙等天敌治虫。或田埂种植香根草等诱集植物，诱杀二化螟、大螟。
灯光诱杀害虫技术每30～50亩稻田安装一盏杀虫灯，于害虫成虫发生期夜间开灯，可诱杀稻纵卷叶螟、稻飞虱等多种害虫的成虫。
稻鸭共育治虫防病控草技术水稻移栽后7～10天、禾苗开始返青分蘖时，将15天左右的雏鸭放入稻田饲养，每亩稻田放鸭10～20只，破口抽穗前收鸭。通过鸭子的取食活动，可减轻纹枯病、稻飞虱和杂草等病虫草发生危害。
合理用药防治病虫技术醚菊酯、噻嗪酮、吡蚜酮、烯啶虫胺、吡虫啉（不用于褐飞虱）、异丙威防治稻飞虱，氯虫苯甲酰胺、丙溴磷防治稻纵卷叶螟，三环唑、咪鲜胺、氟环唑、氯啶菌酯防治稻瘟病，宁南霉素等抗病毒剂与杀虫剂协调使用预防条纹叶枯病、南方水稻黑条矮缩病等病毒病，申嗪霉素、井冈霉素、噻呋酰胺、肟菌酯·戊唑醇、烯肟菌胺·戊唑醇、氟环唑防治纹枯病。
