黄瓜枯萎病是由尖镰孢菌黄瓜专化型真菌侵染引起，属半知菌类真菌。
以菌丝体、菌核和厚垣孢子在土壤中、带菌肥料及种子上越冬。病菌生活能力很强，能在土壤中存活5~6年之久，在8~34℃具有潜伏侵染现象。发病适宜温度为24~28℃，酸性土壤中发病较重，是黄瓜生产上的一种毁灭性病害，一般全生育期均可发病，特别是在棚室栽培的黄瓜为害更重，一般发病率为10%～30%，严重的高达80%～90%，从而严重影响黄瓜产业的发展。
病原菌可从随根部伤口侵入，重茬的次数越多，土壤中残留的病原菌越多，一旦高温、高湿，或根部积水均有利于病害的发生，同时过量的施用氮肥、根结线虫和地下害虫较多的地块，该病害也会相农业技术对较重。
因各地菌株间致病性不同，可以区分出不同生理小种，国外有生理小种1号、2号和3号。我国黄瓜枯萎病菌的致病性与国外不同，命名为生理小种4号。通过调查东北地区保护地黄瓜枯萎病发生情况，包括发生时间、范围及发病规律，提出综合防治方案。
1干热处理或药剂处理
干热种子处理法能预防很多由种子内外带菌而引起的病害，如枯萎病、角斑病、黑星病、叶枯病、炭疽病以及疫病等，对种子的发芽率和种子活力均无不良影响。其具体做法是将种子置于40℃下，预热处理24h后，再转到76℃，热处理72h即可。
播前进行种子消毒，用55℃温水浸种15min，然后催芽播种。或用96%天达噁霉灵粉剂3000倍液+天达2116500倍液浸种
20min，然后用清水冲洗干净，再催芽播种。
以上两种方法可以同时使用，也可以单独使用。
2用无病壤土育苗栽培
选无菌基质作营养土育苗，可以大大降低苗期病害的发生。移栽时尽量带土坨，避免损伤根系。结瓜前应控制浇水，并注意小水轻浇，雨后及时排水，注意氮、磷、钾的配合使用，不要偏施氮肥。定植前可用1∶100的药土对重茬或重症地进行消毒，每667m2用药1.5kg，可选的药剂有甲基托布津、多菌灵、敌克松等，也可用生石灰对地块进行消毒，每667m2用量25kg。
3嫁接
用黑籽南瓜作砧木嫁接黄瓜，可以有效地防治黄瓜枯萎病的发生。这是因为黄瓜枯萎病病原菌对南瓜侵染力较差，可利用南瓜的根系达到抗病效果。嫁接方法有很多，常用的有靠接、插接等。
4高温闷棚
高温闷棚也叫太阳热消毒法，虽然黄瓜枯萎病病菌腐生性强，但很难抵抗45℃以上高温，在45℃的条件下，黄瓜枯萎病菌7天便死亡，所以采用高温闷棚法杀死枯萎病病原菌效果较好。具体做法是：将水稻或小麦的秸秆切成小段与马粪混合施入土壤中，然后起垄浇透水，再全部覆上地膜，最后将棚密闭。此法一般可使20cm以下的地温保持在45℃以上，20天即可杀死土壤中的多种病菌、线虫，同时还能改善土壤理化性质。
5高畦地膜栽培
采用这种栽培方式，土壤温度高，透气性好，有利于根系下扎，增强植株抗病性。加强栽培管理，使植株生长健壮，提高抗病性。一般采用高畦栽培有利于减少病害发生。铺地膜或盖秸秆，加强通风，降低地温，防止大水漫灌，保护好根系。
6轮作和清洁田园
与非瓜类作物轮作3年以上或与非黄瓜等瓜类作物轮作5年以上，施腐熟有机肥，浇水要小水勤灌，忌大水漫灌。此外，在田间发现病株后，立即拔除烧毁，深埋或烧掉，并在病株发生部位用生石灰消毒。收获后，及时清除残株和瓜蔓，并集中处理，千万不能作肥料施用。
7药剂防治
黄瓜发病初期或发病前可用50%多菌灵500倍液、50%苯菌特1500倍液、60%琥·乙膦铝350倍液、50%甲基托布津1000倍液、40%双效灵800倍液、70%敌克松1000～1500倍液等农药灌根预防和治疗，30%甲霜·噁霉灵、38%噁霜·嘧铜菌酯600~800倍液防效显著。早防和早治效果较好，可7～10天灌1次，连灌3次，药剂要交替使用。
