玉米粗缩病的发生完全是由灰飞虱带毒传染所致，所以消灭或避开灰飞虱传播侵染是预防粗缩病发生的重要途径，防治核心是控制毒源、减少虫源、避开危害。
1.选用抗病品种：选用抗病性相对较强的品种，并提倡连片种植，尽量做到播期一致。
2.消灭越冬虫源：冬春季和玉米播种前，清除田间杂草，消灭灰飞虱的越冬繁殖场所，降低越冬毒源，减少传毒机会。
3.调整播期：根据玉米粗缩病的发生规律，尽量使玉米感病敏感期避开第一代灰飞虱成虫迁飞高峰期(5月中下旬-6月上旬)，适当晚播。
4.加强田间管理。适当增加播量，结合间苗定苗，拔出田间病株，集中处理，减少粗缩病侵染源。合理施肥浇水，增加有机肥和磷钾肥，促苗健壮生长，增强抗病虫能力，缩短感病期，减少传毒机会。
5.化学防治。一是药剂拌种，用精粹专用种衣剂或40%甲基异硫磷与20%病毒A按种子量的0.1%-0.15%混合拌种；二是在玉米2-3叶期后至5叶期前，用10%吡虫啉可湿性粉剂或3%啶虫脒乳油1000倍液喷雾，防治灰飞虱，也可加20%病毒A等病毒钝化剂进行防治。
