随着种植年限增长，重茬严重，设施内蔬菜出现死棵的现象越来越多，比如黄瓜、西红柿、豆类等主要品种，都存在严重死棵问题。
死棵的主要原因：1、盐渍化加重；2、病原菌增多；3、线虫危害；4、管理不当造成沤根、烧根。
土传病害蔬菜萎蔫死棵的表现
全株萎蔫死亡是所有萎蔫的最终结果，先期早晚恢复、中午萎蔫，反复数日，植株全株萎蔫死棵。
根部病害种类：疫（腐）霉根腐病、腐皮镰孢菌根腐病、枯（黄）萎病、茎基腐病、青枯病。
1、疫霉根腐病
病株从主根上出现小黑点，后来发展成大片黑斑。典型症状：黑褐色湿腐，严重的茎杆溢缩。纵向劈开，会发现导管是深褐色的。西红柿、彩椒茬比较常见，并且主要在秋延迟这一茬多发。
2、腐皮镰孢根腐病
这几年发生的比较多，也是在西红柿和椒上多发。
在主根或较大的侧根发病，病株根茎部及根部皮层呈深褐色腐烂，最大的特点就是用手一撸根系，其表皮极易剥落，露出木质部。如果横切茎观察，也能看到维管束变色。一般发生在夏秋定植以后，发生较晚，到深秋或冬季开始陆陆续续出现。
3、枯（黄）萎病
以前茄子发生黄萎病比较严重，现在大都采取嫁接，发生的较少了。现在西红柿和彩椒发生多一些，尤其是西红柿枯萎病特别厉害。由于西红柿最近几年病毒病发生比较严重，都种植抗病毒病品种，但是抗病毒病一般都不抗枯萎病。
4、茎基腐病
茎基腐病一般发生在定植初期，秋茬彩椒发生较严重。典型的症状：为害茎基部，初期表皮变成深褐色，发黑，成水侵状，一开始黑斑，然后慢慢绕进一周失水干缩，植株就死亡了。
5、青枯病
青枯病是一种细菌性病害，典型的症状就是挤压的时候出现菌脓。近些年比较少见，因为土壤酸化，细菌在土里存活的比较少。
