苦瓜属喜温耐热蔬菜、种子发芽需30℃左右的温度。苦瓜种子皮厚而硬，透水性差，因此种子发芽比较困难，种植时为苗全苗壮，应进行人工催芽育苗。
首先将种子用新高脂膜浸种，能驱避地下病虫，隔离病毒感染，不影响萌发吸胀功能，加强呼吸强度，提高苦瓜种子发芽率。在种脐部位嗑一小口，便于种子发芽时吸水及胚根（人们通常说的芽）露出。注意，无论采取什么措施在种脐部位嗑小口，均不能伤及内部的种仁。
将种子用干净的湿润毛巾包裹，放在30℃左右的温度下催芽，2-3天后胚根便可露出。在未出芽之前，每天用清水将毛巾和种子透洗一遍，保持种子清洁。发芽后的种子便可播种，因种子个体间出芽有先后的不一致性，有条件的可将先出芽的种子拣出用干净的湿毛巾包好放冰箱的冷藏室低温保存，等绝大多数种子出芽后一起播种。
