制约无公害蔬菜生产的因素很多，而如何在蔬菜病虫害防治中正确选择与使用各种农药，则成为发展无公害蔬菜的关键问题。
一、尽可能选微生物农药。微生物农药或生化制剂如农用抗生素等既能防病治虫，又不污染环境和毒害人畜，反对天敌安全、对害虫不产生抗药性。这类农药主要有井岗霉素、春雷霉素、农用链霉素、Bt乳剂、农抗120等。
二、积极推广土农药。土农药配制较为简单，对某些病虫害却具有良好的防治效果。如800-1000倍液的尿洗合剂(由1份尿素、0.2份洗衣粉、100份水混合而成)、石灰烟草水(石灰少许，溶解后浸泡烟草一昼夜，取其滤液)等，对蚜虫的防治效果可达85％以上；用100-150克碳酸氢铵加水15公斤喷雾，可防治黄瓜霜霉病；将20-30克大蒜捣碎成泥状，加10公斤清水后充分搅拌，取其滤液喷雾，对蚜虫、红蜘蛛均有很好的防治效果。
三、合理使用化学农药。
①严禁使用高毒农药。蔬菜上严禁使用的高毒农药有：甲胺磷、呋喃丹、1605、1059、3911、氧化乐果、杀虫脒、杀扑磷、六六六、甲基异柳磷、甲胺磷、磷化锌、久效磷、氟乙酰胺和有机汞制剂等。有些农药毒性虽然较弱但残留期长，也不宜在蔬菜上使用。如三氯杀螨醇，其成分较难分解，施药一年后作物中仍有残留。
②选择使用高效、低毒、低残留的化学农药。无公害蔬菜生产允许限量使用某些低毒化学农药，如敌百虫、杀灭菊酯、辟蚜雾、克螨特、功夫乳油、波尔多液、DT、多菌灵、甲基托布津、百菌清、代森锰锌、乙磷铝、硫酸锌、磷酸三钠、弱病毒疫苗N14等。
不论选用何种农药，使用前都要充分了解农药的性能和使用方法，根据所防治病虫害的种类使用合适的农药类型或剂型。在防治保护地病虫害时，为降低湿度，可灵活选用烟雾剂或粉尘剂。
需要注意的是，在农药的最后一次使用日期和蔬菜采收的日期之间应有一定的间隔天数，以防止蔬菜产品中残留农药。间隔天数在夏季至少为6-8天，在春秋季至少为8-11天，在冬季则应在15天以上。
