1．穴盘选择。一般选用72孔或50孔塑料穴盘，即每盘可育苗72株或50株。
2．基质准备。根据番茄定植需苗量，准备塑料穴盘数量。按每1000盘72孔穴盘用基质4～5立方米配制混合基质。
3．基质配制。草炭：蛭石＝２∶１或草炭∶蛭石∶废菇料＝１∶１∶１（全部为体积比），覆盖料用蛭石。
4．施肥方法。每立方米混合基质加入15∶15∶15氮、磷、钾三元复合肥2.5千克，或每立方米基质加入1.2千克尿素和1.2千克磷酸二氢钾，肥料与基质混拌均匀后备用。苗期三叶一心后，可结合喷水进行1～2次叶面喷肥。
5．种子处理。用50～55℃温水浸种20分钟，换20～30℃水浸种4～5小时，然后播种、催芽。或播前用10％磷酸三钠水溶液浸种20分钟，然后用清水将番茄种子上的药液冲洗干净，换20～30℃水浸种4～5小时，再催芽播种。
6．播种深度。1.0厘米左右为宜。
7．水分管理。播种后，将育苗基质喷透水（穴盘排水孔有水珠溢出），使基质持水量达到200％以上；苗期子叶展开至二叶一心，水分含量为持水量的65～70％；三叶一心至成苗，水分含量保持在60～65％。
8．温度管理。催芽期间，室内温度可保持25～27℃，预计3～4天出苗。当苗盘中60％出苗，即可将苗盘摆放进育苗温室。日温25℃，夜温16～18℃为宜。当夜温偏低时，可采用地热线加温或其它临时加温措施（烟道加温或热风炉加温等），以免影响出苗速率和出现猝倒病。二叶一心后夜温可降至13℃左右，但不要低于10℃。白天酌情通风，降低空气相对湿度。
