山药用种量大，农户多采用无性繁殖自留种。由于长期不正确的选择和留种方式，没有进行严格的去劣；种薯在晾晒、储运等各个环节中操作不严，不合理的栽培措施、不良环境因素等影响，自然变异严重，使品种丧失原有的优良性状，主要表现为出苗参差不齐、抗病抗逆性降低，块茎变小、畸形、表皮粗糙、肉色发黄、口感生硬，产量降低等。山药在留种应注意以下几点。
1、繁种应选择栽培条件好的田块，避免连作，注意良种区域化，避免长距离运输所带来的薯块损坏、腐烂、病害蔓延等不利因素。田间管理与商品山药田大致相同，但各项管理措施要及时，合理的肥水管理和病虫害防治。注意对其田间综合性状的选择，选取生长健壮、抗逆性强、无病虫害、产量高的植株繁种，去除劣株。山药无性繁殖的材料有山药栽子、余零子，大块茎切块3种。
2、山药收获后进行个选，从外观上看，要选择具有本品种典型性状、无病虫害、无伤口、薯形良好、表皮光滑、肉色洁白、隐芽完好的块茎留种，能有效提高抗病抗逆能力。为恢复和保持品种的优良特性，在选种时最好选用当年用余零子育成的小块茎，或选用栽培过一年的山药栽子（忌用已栽过3年以上的）做种用。贮藏前先放在室外晾晒7—10天，水分蒸发掉15—20%时即可，能加速伤口愈合，防止病菌侵入，防止贮藏期间腐烂，促进隐芽萌发、长出健壮幼芽。
3、山药栽子是山药块茎与藤连接点以下18—550px长的一段，从外观上看，要选择生长健壮、无病虫害、隐芽完好、表皮光滑，肉色洁白、薯形良好，无病虫害，在采收山药时用刀切下，伤口处蘸石灰水或草木灰进行消毒，晒3—4天后在通风阴凉储藏备用。也可用山药块茎切成15—500px的段做种，但出苗比用山药栽子的出苗延迟7—10天，必须与山药栽子分开提前播种或覆膜保温保湿，提早出苗。用余零子（着生在叶腋间的气生块茎）繁殖的，须选择粒大饱满、圆形或椭圆形，播种出苗后的管理同大田栽培山药，当年长成25—750px左右的小块茎作为第二年的繁殖材料。该法可获得大量种用块茎，繁殖容易，而且繁殖的后代生活力旺盛、产量高，可保持优良种性，常用来替换老的山药顶芽。
