大豆根腐病地上部症状与大豆孢囊线虫病相似。
大豆根腐病主要发生在大豆根部，幼苗或成株均染病。初期茎基部或胚根表皮出现淡红褐色不规则的小斑，后变红褐色凹陷坏死斑，绕根茎扩展致根皮枯死，受害株根系不发达，根瘤少、地上部矮小瘦弱，叶色淡绿，分枝、结荚明显减少。
大豆孢囊线虫病在整个生育期均可为害。主要为害根部，被害植株生育不良，矮小，茎和叶变淡黄色，荚和种子萎缩瘪小，基至不结荚。田间常见成片植株变黄萎缩，拔出病株见根系不发达，支根减少，细根增多，根上附有白色的球状物（雌虫-胞囊），也是鉴别胞囊线虫病的重要特征。
