菠萝果实是由许多小果组成的聚合果。该病最初在小果的近果轴处出现半透眀水渍状黄褐色小斑点;随病情进一步发展，出现褐斑的果眼数增加，面积扩大，颜色加深，病斑扩展超出果眼，沿果轴连成一片;最后果轴和果肉几乎全变为褐色。
黑心病的病果初期症状与黑腐病Thielaviopsisparadoxa、酸腐病Pectobacterium
carotovora和酵母发酵病相似，且长有并发现象，较易混淆。与其区别主要有：黑心病病果仍保留菠萝特有的风味和芳香，无异味，不腐烂，很难从外观上区别病健果。酸腐病一旦染病，病组织迅速腐烂，同时产生一种难闻的酸臭味，榨出的果汁因细菌的存在而呈不透明云雾状。酵母发酵病果内部组织软化，产生气体，病部常有大量泡沫状粘液流出，并散发出浓郁的酒糟味，最后仅剩下一空壳，且此病是夏季发生严重。
