针对全省棉区种植结构复杂，种植结构调整后，棉区春季茄科蔬菜种植面积大，有利于棉铃虫的发生，为棉铃虫第3代发生量在棉田陡增创造了条件；棉花品种多，来源杂，抗虫棉面积大，品种特性不甚清楚，有些地方还种有F2代，大大降低了抗虫棉效果；且抗虫棉有利于红蜘蛛和蚜虫为害，尽管棉花迟发，但第3、4代棉铃虫发生期间田间蕾铃丰富，有利于棉铃虫发生。
棉花病虫防治应以防治棉铃虫为主，主要采取如下防治策略：应用综合防治技术，采取适度化防，做到安全用药。
1、积极开展农业防治结合整枝打顶摘卵，中耕培土灭蛹，喷磷避卵。
2、开展生物防治使用生物制剂，如防治红蜘蛛选用阿维菌素类，棉铃虫用核多角体病毒NPV，常规棉还可用Bt制剂，抗虫棉不要使用Bt制剂，以防加速抗虫棉的抗性丧失。通过使用生物农药，保护天敌，充分发挥天敌的控害作用。
3、开展诱杀防治有条件的地方，集中推广高压汞灯、频振式杀虫灯，性诱剂，杨树枝把等诱杀成虫，降低田间落卵量。
4、适度化学防治棉花中后期，防治对象以棉铃虫为主，要合理使用化学农药。当3代棉铃虫1－2龄幼虫为15－20头／百株时，选用虫卵兼治的杀虫剂拉维因，或是内吸性好、毒性中等、能兼治红蜘蛛和棉蚜的三唑磷，其15％三唑磷微乳剂效果更好，禁止使用3911、杀虫眯，慎用1605、甲胺磷等。抗虫棉对棉铃虫有一定的抗性，并不是无虫棉，它不能减少落卵量，目前，抗虫棉存在着四个问题，一是品种多，由于品种不同，相同品种来源不同，其抗虫性差异明显；二是前两年棉铃虫发生轻，其抗性没经过棉铃虫大发生的考验；三是还有些地方种植的是F2代，在田间分离严重；四是抗虫棉棉株不同部位对低龄棉铃虫幼虫抗虫能力不同，花瓣最强，幼蕾、苞叶次之，花蕊和棉叶第三，而我省3、4代棉铃虫主要为害棉铃。因此，抗虫棉的棉铃虫防治更要特别注意，加强监测，及时防治。当百株单叶伏蚜达2000头，或卷叶率达5％时，可选用10％大功臣、吡虫量啉类或啶虫磷，防治红蜘蛛，0．9％阿维菌素类虫螨克或15％哒螨灵。
5、改进施药技术推广弥雾机和小孔片喷雾技术，可以减少农药用量的30％，提高防效25％以上。用药喷雾时，要加足水量，亩用水量至少用50公斤，可提高防效。合理轮换使用农药，延缓抗性产生。
