1、在二化螟越冬地块上于化蛹盛期进行深灌，灌水3-4天，可消灭越冬虫口。在水稻生长期，即二化螟幼虫初蛹期，采用烤田或浅灌水，促进降低化蛹部位，至化蛹高峰期，猛灌深水（10cm以上）3-4天，能淹子大部分老熟幼虫和蛹。
2、点灯诱蛾、人工摘卵，以及拔除早期被害株。齐根拔除枯孕穗、白穗和虫伤株，均能有效地防止危害。
3、水稻二化螟防治适期一般掌握在卵孵高峰期后5～7天。孵化始盛期，当枯心团达900个以上/公顷，应立即用药，或在卵孵盛期内对大肚10%到抽穗80%的田块掌握5%～10%破口露穗时用药防治。防治药剂可用：25%杀虫双，防枯心用200倍液喷雾，防白穗用150～200倍液喷雾。施药期需保持3mm田水3～5天。40%螟施净乳油，是一种有机磷杀虫剂，同时具有胃毒、触杀、杀卵的效果。卵期到幼虫初龄期均可用药。可在拔秧前3～5天，用300倍液喷雾，可预防大田枯心和枯鞘。稻田用药时应有寸水，并保持3～5天。也可在始见枯鞘或枯心时用800倍液喷雾，破口抽穗期700倍液喷雾。还可以选喷50%杀螟松乳油1000倍液，或1.8%阿维菌素乳油3000～4000倍液，或42%特力克乳油2000倍液。
4、处理好越冬期间未处理完的稻桩和其他寄主残株，破坏其越冬场所，压低越冬虫源。施用硅肥后水稻抗性提高，对二化螟有一定预防效果。