茄子萎蔫的主因有疫病、菌核病、茎基腐病、青枯病、黄萎病、根结线虫病、肥害等。具体诊断如下：
1、看田间分布。当发生肥害后，一般会出现晴天中午萎蔫，傍晚恢复正常，严重的可造成植株死亡。而以上其它病害，其田间分布形状为点片分布。
2、看根部是否有根结。发生根结线虫病，根部可见大小不等的根结。而以上其它病害则没有根结。
3、看维管束是否变褐。茄子黄萎病和细菌性青枯病的维管束都变褐，以上其它病害无此症状。这两种病害在苗期不表现症状，在开花结果后开始表现。但黄萎病从下往上，病茎杆维管束呈黄褐色，潮湿时，茎基产生白色霉状物，在叶缘和叶脉间出现不规则的淡黄色斑块，近主脉处仍保持绿色，呈褐色掌状斑驳，后发病部位枯死，呈花皮状，且有时会出现半边疯的现象。而细菌性青枯病的病茎中、下部皮层粗糙，常长出长短不一的疣状突起和不定根，有时在病茎上发生油渍状褐色不规则斑状。如将病茎做横切面检查，略加挤压，有乳白色黏液溢出(菌脓)。
