发病症状缺锌多出现在植株中、下部叶上，植株多呈矮化状态。上部叶片细小，呈丛生状，俗称“小叶症”，一般不出现黄化现象。
从中部叶开始褪色，与健康叶比较，叶脉清晰可见，随后叶脉间叶肉逐渐褪色，有不规则形的褐色坏死斑点，叶缘也从黄化逐渐变成浅褐色至褐色。因叶缘枯死，叶片会向外侧稍微卷曲，并有硬化现象。
坏死症状发生迅速，几天之内就可能导致叶片枯萎。生长点附近的节问缩短，新叶不黄化。叶片尤其是小叶叶柄向下弯曲，卷起呈圆形或螺旋形。果实色泽偏向橙色。
发病规律锌在植物中起着重要作用，参与蛋白质合成，例如含锌的色氨酸是合成生长素吲哚乙酸(IAA)的原料，缺锌会导致生长素的减少，影响茎叶生长。碳酸酐酶存在于叶绿素中，催化CO2和水生成碳酸根和氢气，此酶和锌量是平衡关系，可见，锌与光合强度有密切关系。锌还关系到叶绿素的合成和稳定，缺锌时中部叶片黄化。锌可改善糖的代谢，关系到碳水化合物的合成和运输。
缺锌是由于多种因素造成的。淋溶强烈的砂土全锌含量很低，有效锌含量更低，施用石灰时极易诱发缺锌现象。花岗岩母质发育的土壤和冲积土有时含锌量也很低。碱性土壤中锌的有效性低，一些有机质土如腐叶土、泥炭土，锌会与有机质结合成为不易被作物吸收利用的形态。光照过强，吸收磷过多，土壤pH值高，或低温、土壤干旱，土壤内的锌元素释放缓慢，番茄植株会因得不到充足的锌供应而缺锌。再者，磷的施用可抑制植株对锌的吸收。
防治方法苗期提高设施温度，白天温度保持在20℃以上，夜温保持在15℃左右，同时保持土壤湿润。不要过量施用磷肥。目前，锌肥主要为硫酸锌，此外还有氧化锌、硝酸锌、碱式硫酸锌、碱式碳酸锌、尿素锌、乙二胺四乙酸螯合锌及含锌的复合叶面肥等。生产上为预防缺锌，通常于定植前在基肥中施用硫酸锌，每667平方米施用1.5千克。作为应急对策可用硫酸锌0.1%～0.2%水溶液喷洒叶面。
