冬芹菜的苗龄期70-90天，定植期在9月下旬至10月中旬。如果把秋冬芹菜的苗龄期都分为前后两段时间，前期与后期的自然条件明显差异较大，因此栽培管理技术措施也明显不同，因此要双向管理。
苗龄期的前半期管理
芹菜播种后2天即可出全苗。栽培管理的首要措施是浇水。因幼苗小，尚未行根，盖沙薄，不可浇灌。此时期日光强烈、温度高，土壤水分蒸发量大，苗床易干，所以必须勤浇洒，播种后10天内，于每天上午洒一次水；11天-20天隔一日洒一次水；21天-35天，相隔2-3日洒一次水，要保持畦面见湿不见干，间隔天数越多洒水量越大；35天之后，苗子已长大，可改为浇灌。
第二项重要栽培措施是大风雨过后及时通风降温。在夏季，当风雨到来之际，为避免大风刮棚膜，不管是在白天还是在夜间，都要及时关闭通风口。但关闭通风口后，棚室内很快形成高温高湿的不良小气候，这对芹菜苗生长极为不利。因此，风雨过后要及时打开所有通风口，昼夜大通风。必要时采取强制通风，加大通风排湿量，确保芹菜苗不受灾害。其次，要在烈日中午前后覆盖遮阳网，避免强光日灼菜苗，并与所有通风口安装上避虫网，防止害虫潜入棚内为害芹菜苗。
苗龄期的后半期管理
此期间已是秋季，自然光照和温度条件都适宜芹菜苗的需求。栽培管理的重点应转向水肥供应。掌握7-8天浇一次水，保持畦面湿润。隔一次水冲施一次高钾肥料，每亩每次冲施7-8公斤。一直用到移栽取苗前的10天。芹菜对钙、硼元素都敏感，如果缺钙发生心腐病，缺硼易出现叶柄、茎劈裂等症状。芹菜对钙和硼的吸收，靠钾带动，如果土壤中不缺钙、硼，而缺钾，因钙和硼不能被芹菜吸收，仍然出现缺钙病和缺硼症。为培育芹菜壮苗，在育苗期就应特别重视增施速效钾肥。
在芹菜育苗后半期，易发生芹菜斑枯病。防治措施，一是栽培防治：要降温排湿，育苗后期白天温度控制住15℃-20℃，高于20℃及时通风降温，夜间控制在15℃左右；缩小昼夜温差，减少结露，切忌大水漫灌，遇旱要小水勤浇，使苗畦土壤相对湿度不超过80%。二是使用药剂喷雾防治：15公斤清水中加入10%噁醚唑（世高）水分散粒剂7.5克，再加入70%甲基硫菌灵或甲托可湿性粉剂15克，喷雾全株。或用75%百菌清（达克宁）可湿性粉剂兑水600倍液喷雾全株。也可亩用45%百菌清烟剂300-350克，严闭棚室熏烟7-8小时。
