1．肉质根分叉、弯曲
胡萝卜生产中造成肉质根分叉、弯曲的原因很多，主要有：胡萝卜种子寿命短，采用陈种子栽培时，因陈种子的生活力弱，发芽不良，影响幼根先端生长，而产生分叉、弯曲的异形根；土壤黏重，或土中有砖石、树根、废塑料薄膜等杂质，使胡萝卜的生长受阻而产生异形根；施用新鲜厩肥，肥料在土壤中发酵、发热，或化肥使用浓度过高，胡萝卜的主根在土中受损以后产生侧根，地上部分积累的养分贮藏在侧根中，而形成胡萝卜的异形根；间苗过晚或定苗过密、过稀时，根系生长拥挤，主根弯曲，或营养面积过大，主、侧根同时肥大，都会形成胡萝卜的异形根；土传病虫害如线虫病、蛴螬、蝼蛄类危害主根，主根受伤以后植株地上部分积累的营养物质贮藏到侧根中产生叉根。
为解决胡萝卜生产中出现叉根，弯曲等畸形根，应尽量使用新鲜的、充分成熟的种子作生产用种，防止因种子生活力降低而产生畸形苗；土壤必须深耕细作，拾去树根、砖瓦、石块、旧薄膜等杂质，播在深沟高畦、排水良好的土壤中；不施未经腐熟的基肥和浓度过大的化肥；及时间苗，保证幼苗应有的营养面积，促进主根正常生长；在土壤病虫害较多的地区，播种前施用杀虫剂或杀菌剂，防止地下病虫害的发生。
2．肉质根开裂
胡萝卜肉质根的开裂不仅影响胡萝卜的质量，而且容易引起腐烂或不耐贮藏。造成胡萝卜肉质根开裂的主要原因是生长期中土壤供水不匀所致，尤其是生长初期遭受干旱，表皮硬化，内部细胞分裂缓慢，而生长中、后期由于下雨或大水猛灌，水分增加过快，内部细胞分裂加快，硬化的表皮不能相应地生长，出现开裂现象。所以栽培上要注意适当供水。裂根率也与生长期的长短有关，裂根一般都发生在生长后期，从摇种到收获的天数越多，即收获越晚，裂根越多。因此，收获不能过晚。
3．肉质根着色不良
胡萝卜肉质根的颜色有多种，其色素主要由胡萝卜素、叶黄素、番茄红素等构成。其着色的好坏与温度、土壤等生产条件有关。一般温度低于16℃或高于21℃，胡萝卜肉质根形成不良，所以胡萝卜形成期间的温度以16～21℃为最好。土壤排水良好、空气充足、通透性好，则着色良好；反之，土壤坚实，空气少、排水不良，则着色差。土壤中钾、镁含量多，也可提高胡萝卜的着色度。因此，栽培胡萝卜在施用氮、磷、钾的同时，还应施用镁肥。
4．肉质根中心柱增粗
胡萝卜中心柱的粗细除因品种不同而有差异外，也与栽培技术有关。如栽培营养面积过大、植株生长旺盛、叶数增多、腋芽发生早而发达，使胡萝卜肉质根粗大，中心柱也随之大而发达。所以间苗时应根据品种特性，按规定的行株距留空隙，不宜过大。
5．肉质根表皮出现的生理病害
(1)病斑在土壤干燥、施肥过浓、土壤酸性或碱性较强、含钾或铵离子过多的条件下，钙的吸收受到阻碍，常会引起缺钙症，而使胡萝卜的根部产生圆形的黑色斑点。
(2)瘤子胡萝卜夏播胡萝卜株行距过大、植株生长旺盛、肉质根发达，或植株生长的中后期土壤干燥、盐碱过重、温度过高等，都会发生瘤子胡萝卜。因此，间苗时应按规定保持行株距，不宜过大。多施疏松腐熟的有机肥料、防止土壤盐碱过重、均匀供应土壤水分等措施，均有利于防止瘤子胡萝卜的发生。
(3)青肩胡萝卜栽培胡萝卜的行株距过大，肉质根长大后肩部露出土表，受阳光照射后变成青色，称为青肩胡萝卜。防止方法是间苗不宜过稀，胡萝卜长大后应及时中耕培土，防止肩部露出土面。
