萝卜收获后，常见心部发黑或已干成失水状，这是由萝卜黑腐病造成的。病源菌主要从伤口侵染，地势低洼、排水不良的地块最易发病，会造成大幅减产，降低萝卜质量。发病的萝卜入窑后还会发生心部腐烂。
萝卜黑腐病要早防，可采取高垄栽培法，铲趟不可伤根，及时防治地蛆，减少伤口便可减轻黑腐病的发生。在前茬作物是白菜、芥菜、甘蓝等地块种萝卜，追施化肥要稍远离根部，施有机肥要充分腐熟，避免伤根烧根。选择排水良好的地块种萝卜，灌水时不可大水漫灌，可减少病菌侵入机会，减轻病害的发生。
发现患病的萝卜，要及时拔出带到田外深埋，防止遗在田里污染土壤，感染下茬作物。害病萝卜不可留种，以防病菌传染蔓延。另外，萝卜生长后期要控制氮肥用量，同时注意土壤硼的供应，以防萝卜产生黑心的现象。
