甘蔗赤腐病主要危害叶片、叶鞘、茎根，其中茎、叶受害重。叶片染病最初在中脉上产生小红点，后扩散为梭形斑，病斑四周红黑色，中部黄白色，其上具分散的小黑点，即病菌分生孢子盘上产生的刚毛。叶鞘染病初现红色不定形的大斑，后逐渐变为黄白色，有时病鞘相邻节间表面也生红色的小型病斑。茎部染病维管束上生有纺锤形的小红点，后红点逐渐扩大，节间组织变为暗红色，病斑中间散生小白点，后期茎内组织干枯下陷，有的产生菌丝体或红我以的分生孢子盘，病情向外扩散后茎的表皮失去光泽，产生明显病症，病部下隐、枯死，在坏死组织表面生出黑色小粒点，即病原菌的分生孢子盘。
