选用较抗病的番茄红色硬果种植；与不易感染灰霉病的作物轮作换茬3年以上。采用地膜暗灌或滴灌，晴天上午浇水，避免大水漫灌，浇水后及时通风降湿。合理密植，防止密度过大，造成中下部通风透光不良；适时整枝打杈，摘取下部老叶和病花、病果、病枝叶，带出棚外集中销毁深埋。
闷棚消毒。收获后清除病残体，棚室调控温湿度创造不利于灰霉病发病条件。冬季晴天上午放风30分钟，将湿度降到75%以下，然后紧闭棚室，棚内温度上升到30℃后放小风，将温度控制在28℃~32℃；下午加大通风量，将湿度控制到70%以下。
烟雾法。发病初期在傍晚点燃发烟闭棚熏1夜，次晨通风，隔7天再熏1次。或者用喷雾控制。药后及时通风降湿，避免因施药增加棚室内湿度；坚持轮换用药和交替用药；也可在用药时加入新高脂膜使用提高防治效果，减少药剂用量。
