菠菜枯萎病菌主要随植株病残体在土壤中或种子上度夏或越冬。种子可带菌，未腐熟的粪肥也可带菌。病菌可随雨水及灌溉水传播，从根部伤口或根尖直接侵入。高温多湿有利于发病；土温30℃左右、土壤潮湿、肥料未充分腐熟、地下害虫、线虫多时易发病。
防治：（1）与葱蒜类、禾本科作物实行3―5年轮作，避免连作。
（2）施用充分堆制或腐熟的有机肥，并采用配方施肥技术，提高菠菜抗病力。
（3）采用高畦或起垄栽培，雨后及时排水，严禁大水漫灌。
（4）发现病株及时拔除，病穴及四周浇、喷50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，或40%多硫悬浮剂500倍液，或10%治萎灵水剂300―400倍液，隔半个月喷一次，连喷2―3次。
