生物有机肥料具有养分齐全、肥效稳而长、能改善土壤理化性状、提高土壤保肥保水能力等特点，宜作为基肥施用，一般每亩施50~120公斤。施用生物有机肥时应注意以下几点：
在高温、低温、干旱条件下不宜施用。
生物有机肥中的微生物在25℃~37℃时活力最佳，低于5℃或高于45℃活力较差。
生物有机肥中的微生物适宜的土壤相对含水量为60%~70%。
生物有机肥不能与杀虫剂、杀菌剂、除草剂、含硫化肥、碱性化肥等混合施用，否则易杀灭有益微生物。还应注意不要让阳光直射其上。
生物有机肥在有机质含量较高的土壤上施用效果较好，在有机质含量少的瘠薄地上施用则效果不佳。
生物有机肥不能取代化肥，它是与化肥相辅相成的；与化肥混合施用时应特别注意其混配禁忌。
