由于迷你黄瓜育种困难，种子价格较贵，育苗时一般采用穴盘进行精量点播，为了获得高产，防止重茬病虫害，提高迷你黄瓜抗病性和吸收养分的能力，以获得最好的经济效益，生产上常采用黑籽南瓜进行嫁接育苗。其具体方法是：
（1）嫁接育苗需在一定保护设施内进行。以利于保温保湿，特别是冬春季要有较好的保护措施。
（2）砧木苗育苗选择上一年的黑籽南瓜种，用10~15毫克/升的赤霉素浸种12小时后晾种18小时，再进行浸种催芽，将种子放入55~60℃水中浸15分钟，待自然降至室温后浸种12小时，然后搓掉表面黏液，清水洗净并晾干表面水分后用纱布包好，在28~30℃中催芽，出芽后点播于装好营养土的育苗钵中，播种前浇透水，播后覆细土潮土2.0厘米厚。播种后加强保温，促进出苗，保持白天28~30℃，夜间18~20℃，当下胚轴长5~6厘米，子叶展平，心叶露尖时即可嫁接。
（3）接穗苗培育选种后进行温汤浸种（若种子有包衣不必浸种催芽），即55℃热水烫种15~20分钟，自然冷却后浸种4~5小时，挫去种皮黏液后用0.1%的高锰酸钾浸泡30~60分钟，捞出洗净控干，置于25~29℃下催芽，1~2天即可出芽，出芽后点播于装好穴盘基质的穴盘，播前浇透水，播后扣棚盖膜，白天保持25~30℃，夜间保持15~20℃，出苗后保持白天22~25℃，夜间14~16℃，当接穗苗胚轴高6~7厘米，子叶肥厚展平时即可嫁接。
（4）嫁接方法当迷你黄瓜播后6~8天，子叶刚展平，而砧木心叶露头时为进行插接法嫁接的最佳时期。嫁接时先将接穗苗起出，然后去除砧木生长点和真叶，再用接穗茎粗相同的竹签，从砧木一侧子叶基部相对侧朝下斜插0.5厘米，但竹签尖端不要插破砧木茎的表皮，也不要插入髓部。将接穗在子叶下0.8~1.0厘米处下刀斜切2段，切口长0.6厘米，再从另一面下刀，把下胚轴切成楔形，然后将插在砧木中的竹签拔出，将削好的接穗插入孔中，并使接穗的两片子叶同砧木的两片子叶成十字形。嫁接完后用嫁接夹固定，切接口时要一次切成，接穗与砧木插接时也应一次插成，不能来回移动。
