苗子定植后，正是番茄花芽分化的主要时期，想要减少畸形果数量，加强定植后的苗期管理最为关键。
一是改善棚室环境是基础
不利的棚室环境是造成蔬菜花芽分化不良的主要原因。秋延迟番茄定植时间主要集中在7月下旬到8月份，定植较早的部分番茄，正好遇到一年中最热的时间段，棚外气温经常在35℃以上，更不要说棚内了。当前建造的冬暖式蔬菜大棚，只有棚前脸和顶部两个通风口，通风质量远远要比拱棚差，空气流通慢，热量散失也慢，使得棚内温度明显高于外界，尤其是中午前后光照强烈，如果不覆盖遮阳网，棚内地表温度甚至在50℃以上，直接烫伤苗子。因此，菜农应密切注意天气变化，严格调控好棚室温度、湿度和光照环境，严防温度过高或过低。
二是做好营养补充
植株的营养状况将直接影响到蔬菜花芽分化和果实的发育。蔬菜定植后一定要合理施肥，保持充足的营养供应。但需注意的是施肥一定要科学合理，要学会配方施肥，底肥以鸡鸭粪肥为主的地区，土壤中氮磷含量较高，钾含量较低，要注意通过冲施肥和叶面肥做好调节，以免植株营养生长过旺，花芽分化不良，致使蔬菜开花坐果率低或畸形果多。
三是调节蔬菜长势，避免徒长
植株徒长是造成蔬菜花芽分化不良、开花坐果率低、畸形花果多的一个主要原因。因此，在蔬菜栽培管理的过程中，一定要采取措施控制植株徒长。一般来说，控水控温是最常用的控旺手段，应以此为主，结合助壮素、叶绿素等喷洒生长点进行控制。
合理点花把好坐果最后一关
点花药剂对坐果和果形有很大的影响，如采取熊蜂授粉的番茄，果实更加圆润短粗，果个看起来稍小，但内容物充实，产量并没有降低；而采取点花药处理的果实显得更高些，果个大，但容易出现空心。
疏果宜早不宜迟
番茄畸形过特别多，尤其是露籽果、裂果等较为严重的畸形果，基本没有商品价值，在集市上卖都没人要，因此要特别注意及时疏果，发现畸形花的直接摘掉，点花后幼果刚长出来时，很多畸形就可以发现，这些要早发现早摘除。
